Ассоциация «Национальная база медицинских знаний» совместно с АНО «Врачебная палата Федерального Медико-Биологического Агентства» (ФМБА России) реализовали в начале 2019г. пилотный проект создания «Оператора биомедицинских данных». В качестве платформы для сбора деперсонифицированных данных и машинного обучения применялась система Webiomed.
Поставщиками медицинских данных в пилотной фазе проекта выступили свыше 12 медицинских организаций, подчиненных ФМБА России и использующих медицинские информационные системы «КМИС» и «Медеора». Также поставщиком данных согласилась выступить сеть медицинских центров «Открытая клиника».
В результате реализации пилотного проекта на базе АНО «Врачебная палата ФМБА» был создан центр обработки данных, в котором установлено программное обеспечение Webiomed.DataSet для сбора «сырой» медицинской информации. С его помощью участники проекта осуществляли сбор деперсонифицированных медицинских данных для последующей их обработки, создания DataSet-ов и проведения машинного обучения.
В итоге в тестовой версии платформы были накоплены сведения о 298 тыс. «цифровых двойников» пациентов, включая деперсонифицированные сведения о случаях обследования и лечения, анамнезе пациентов, зарегистрированных окончательных диагнозов и медицинских протоколах в формате структурированных электронных медицинских документов (СЭМДов).
Выполнена разметка и верификация собранной информации. В качестве пробы создана демонстрационная версия DataSet-а, содержащего данные об инфарктах и инсультах. В ходе пилотного проекта проверено 6 различных алгоритмов машинного обучения (ML) и глубокого обучения (DL) для определения лучшего алгоритма решения поставленной задачи. По результатам предварительного моделирования получена оценка F1, равная 90.1%, что свидетельствует о высокой точности выбора самих признаков и алгоритма машинного обучения «k Nearest Neighbor».
Дополнительная информация: http://nbmz.ru/operator-dannyh/
Новости о проекте: